按连接糖链的数目可分：单糖链苷、双糖链苷等；按其来源分类可分为人参皂苷、柴胡皂苷等
按苷的生理作用分类，如强心苷。有的按苷的特殊物理性质分类，如皂苷
（一）按苷元的化学结构分类
根据苷元的结构可分为氰苷、香豆素苷、木脂素苷、蒽醌苷、黄酮苷、吲哚苷等。如苦杏仁苷、七叶内酯苷、靛苷。
（二）按苷类在植物体内的存在状况分类
原存在于植物体内的苷称为原生苷，水解后失去一部分糖的称为次生苷。
如苦杏仁苷（原生苷），水解后失去一分子葡萄糖生成野樱苷（次生苷）。
（三）按苷键原子分类
按苷键原子的不同可将苷分：O-苷、S-苷、N-苷和C-苷，其中以O-苷最为常见。
1.氧苷（O-苷）
以苷元不同又可分为醇苷、酚苷、氰苷、酯苷和吲哚苷。
（1）醇苷
通过醇羟基与糖端基羟基脱水而成的苷，如红景天苷、毛莨苷、獐牙菜苦苷、海星环苷等。
醇苷苷元中不少属于萜类和甾醇类化合物，其中强心苷和皂苷是醇苷中的重要类型。
（2）酚苷
通过酚羟基而成的苷，苯酚苷、萘酚苷、蒽醌苷、香豆素苷、黄酮苷、木脂体苷等都属于酚苷。如天麻苷、水杨苷等。
（3）氰苷
主要是指一类α-羟腈的苷。
特点：多数为水溶性，不易结晶，容易水解，尤其有酸和酶催化时水解更快。生成的苷元α—羟腈很不稳定，立即分解为醛（酮）和氢氰酸，而在碱性条件下苷元容易发生异构化。
注意：苦杏仁苷水解后可产生HCN，对呼吸中枢起镇静作用，故少量服用可起镇咳作用，但大剂量可中毒，引起组织窒息。因此对含氰苷的中药或制剂要严格控制用药量。
氰苷中的γ-羟腈苷和氧化偶氮基类等，水解不产生氢氰酸。例如垂盆草苷就属于γ-羟腈苷，遇稀碱即能定量地转变成为异垂盆草苷，而不生成氢氰酸。
（4）酯苷
苷元以羧基和糖的端基碳相连接。
特点：苷键既有缩醛性质又有酯的性质，易为稀酸和稀碱所水解，如山慈菇苷A。
某些二萜和三萜的羧基上也常构成酯苷结构，尤其在三萜皂苷中多见，如土槿皮甲酸和乙酸。
（5）吲哚苷
吲哚醇与糖的端基碳相连，如豆科属和蓼蓝中特有的靛苷。其苷其苷元吲哚醇无色，易氧化成暗蓝色的靛蓝。（中药青黛就是粗制靛蓝，有抗病毒作用）
2.硫苷（S-苷）
糖端基羟基与苷元上巯基缩合而成的苷称为硫苷。如芥子苷、萝卜苷等。煮萝卜时的特殊气味与硫苷元的分解产物有关。
3.氮苷（N-苷）
通过氮原子与糖的端基碳相连的苷称为N-苷，苷元通常是嘌呤或嘧啶及其衍生物。如核苷类物质腺苷、鸟苷、胞苷和尿苷等，都为嘌呤或嘧啶的β-D-核糖苷。另外，中药巴豆中的巴豆苷是与腺苷结构相似的N-苷。
4.碳苷（C-苷）
碳苷是一类糖基直接以C原子与苷元的C原子相连的苷类，由苷元酚基所活化的邻或对位氢与糖的端基羟基脱水缩合而成。
碳苷以黄酮碳苷最为常见，常与O-苷共存，如牡荆素。芦荟苷是最早发现的结晶性蒽酮碳苷。
特点：碳苷类具有溶解度小，难于水解的共同特点。
苷的结构分类总结：
类型
含义
代表性化合物
氧苷
醇苷
通过醇羟基与糖端基羟基脱水而成
红景天苷、毛茛苷、獐牙菜苷、海星环苷
酚苷
通过酚羟基与糖端基羟基脱水而成
天麻苷、水杨苷
氰苷
主要指一类α-羟基氰的苷
苦杏仁苷
酯苷
苷元以羧基和糖的端基碳相连的苷
山慈菇苷A、土槿皮甲酸和乙酸
吲哚苷
吲哚醇与糖的端基碳相连的苷
靛苷
硫苷
糖端基羟基与苷元上巯基缩合而成的苷
萝卜苷、芥子苷
氮苷
通过氮原子与糖的端基碳相连的苷
腺苷、巴豆苷
碳苷
糖基直接以C原子与苷元的C原子相连的苷
芦荟苷、牡荆素
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